Кирисима Харуто живет спокойной размеренной жизнью в небольшой деревеньке под названием Хиросима. В один прекрасный день у него дома поселяется приехавшая из Токио девушка по имени Юдзуки Эба.

Среди вершин Арарата секретная организация Аркам обнаруживает нечто похожее на Ноев ковчег. Объектом хочет завладеть одно из подразделений Пентагона, и остановить его может только Спригган —